Genom Ikan Peliharaan Anda Sangat Aneh


Manusia telah dijinakkan sejumlah besar hewan sepanjang sejarah mereka, sebagian untuk makanan, sebagian sebagai sahabat dan pelindung. Beberapa spesies — anggap hewan seperti kelinci dan marmot — sebagian telah bergeser di antara dua kategori ini, saat ini berfungsi sebagai makanan dan hewan peliharaan. Tetapi satu spesies telah meninggalkan masa lalunya sebagai sumber makanan sepenuhnya. Dan, dalam kelangkaan lain, itu akhirnya tidak berfungsi sebagai pendamping tetapi sebagai hiasan.

ARS TECHNICA

Kisah ini awalnya muncul di Ars Technica, sumber tepercaya untuk berita teknologi, analisis kebijakan teknologi, ulasan, dan banyak lagi. Ars dimiliki oleh perusahaan induk WIRED, Condé Nast.

Di sini kita membicarakan ikan mas, dan sekarang kita telah melihat genomnya. Dan itu hampir sama anehnya dengan ikan itu sendiri.

Ada baiknya berhenti sejenak untuk mempertimbangkan betapa anehnya mereka dalam dunia domestikasi. Mereka mulai hanya sebagai varian ikan mas yang sedikit berwarna yang digunakan seluruhnya untuk budidaya. Kami telah benar-benar menghapusnya dari rantai makanan dan mengubahnya menjadi hewan peliharaan, tetapi mereka bukan jenis hewan peliharaan yang berinteraksi dengan kami seperti anjing atau kucing, atau bahkan marmot. Sebagian besar, mereka hanya duduk di sana dan terlihat dekoratif. Dan dalam proses membuatnya lebih dekoratif, kami telah membiakkan banyak varietas yang jauh kurang berfungsi seperti ikan.

Ada juga sedikit sejarah aneh di sini. Meskipun kami menyebutnya ikan mas secara umum, sebagian besar yang kami miliki bukanlah ikan mas emas yang sebenarnya. Setelah didomestikasi di China (dan kemudian pindah dari kolam taman ke tangki dalam ruangan), ikan berwarna emas akhirnya disimpan untuk kaisar, jadi mereka masih cukup langka. Sementara itu, kami telah membiakkan strain dengan banyak ekor, strain yang tidak memiliki sirip punggung, dan banyak lagi.

Itu mungkin menyebabkan beberapa hal aneh pada ikan, secara genetik. Tapi ternyata mereka cukup aneh untuk memulai.

Bahkan proses pelaporan genom ternyata agak aneh. Ini pertama kali dilaporkan pada bulan Mei, ketika sebuah kelompok mendeskripsikan genom ikan mas dan membandingkannya dengan leluhurnya, ikan mas. Tetapi analisisnya cukup minimalis. Kemudian, minggu ini, sebuah konsorsium besar menjatuhkan analisis tidak hanya strain ikan mas tetapi 185 strain yang berbeda. Ditambah 16 genom ikan mas liar yang berbeda untuk perbandingan. Meskipun panjang genom ikan mas hanya 1,8 miliar pasangan basa (1,8 gibas), urutan mentah yang diperlukan untuk melakukan semua ini mencapai 4,3 triliun basa. Ini upaya yang luar biasa.

Tetapi karena beberapa kelompok lain sudah mempublikasikan datanya, para peneliti menerbitkannya di PNAS menggunakan jalur yang hanya menempatkannya melalui peer review informal. Tampaknya tidak ada masalah dengan makalah yang akan menyebabkannya gagal dalam tinjauan sejawat, tetapi penerbit biasanya menginginkan hasil yang baru, dan ini tampaknya tidak cukup baru.

Kebanyakan hewan memiliki dua set kromosom yang serupa, masing-masing dari ibu dan ayah mereka. Pada manusia, ada 23 kromosom, dan kita masing-masing memiliki dua, artinya kita masing-masing membawa 46 kromosom. Pada ikan mas dan ikan mas asalnya, ada 25 kromosom, tetapi setiap ikan membawa 100 kromosom — alih-alih dua salinan, mereka memiliki empat, atau lebih tepatnya dua set dua. Rupanya, garis keturunan yang menghasilkan ikan mas adalah hibrida dari dua garis keturunan yang berkerabat dekat (mungkin spesies yang terpisah tetapi berkerabat dekat).

Akibatnya, kecuali beberapa salinan gen telah dihapus atau dilumpuhkan oleh mutasi, ikan harus memiliki empat salinan di antaranya. Tetapi ada beberapa kasus tertentu yang tidak terjadi, seperti gen perbaikan DNA, di mana satu set salinan telah dihilangkan. Dan di banyak jaringan, satu atau kumpulan gen lain lebih aktif, tetapi tidak ada pola yang jelas dan konsisten dari kumpulan itu. Jadi kita tidak berada pada titik di mana kita benar-benar memahami apa yang terjadi dengan empat set gen ikan, tetapi jawabannya tidak mungkin sederhana.

Ikan-ikan tersebut baru saja diisolasi dan telah menjalani seleksi yang cukup serius untuk ciri-ciri yang tidak biasa — lihat saja gambar di daftar strain ikan mas Wikipedia. Banyak dari varian genetik yang mendasari sifat fisik ini kemungkinan besar baru dan telah dipilih sebagai satu-satunya varian yang ada dalam strain tersebut. Ini menciptakan apa yang disebut “sapuan selektif” di mana varian tersebut, dan varian lain yang kebetulan ada di dekatnya saat muncul, adalah satu-satunya yang ada dalam suatu populasi.

Diposting oleh : joker123

Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan.