Seberapa Cepat Ilmuwan Dapat Menemukan Strain Coronavirus Baru?

Seberapa Cepat Ilmuwan Dapat Menemukan Strain Coronavirus Baru?

[ad_1]

Dari lebih dari 21,5 juta kasus Covid-19 yang secara resmi dilaporkan di AS, sampel dari hanya 59.438 orang, atau kurang dari 0,3 persen, telah diurutkan dan dianalisis untuk variannya, menurut GISAID. Sebaliknya, Inggris secara teratur mengurutkan lebih dari 10 persen kasus Covid-19. Itu memungkinkan pejabat kesehatan masyarakat Inggris untuk memantau secara real time ketika varian B.1.1.7 berubah dari penemuan langka pada awal Desember menjadi mendominasi infeksi baru tiga minggu kemudian. Orang Inggris mungkin menjadi contoh yang luar biasa dalam hal ini, tetapi mereka tidak sendiri. Menurut a baru-baru ini Washington Post Analisis, 42 negara lain telah mengurutkan lebih banyak kasus daripada AS, terlepas dari fakta bahwa Amerika menyumbang seperempat dari semua infeksi virus korona secara global.

“Apa yang dilakukan AS saat ini sama sekali tidak memadai,” kata Chiu. Dia pikir pejabat pemerintah Amerika harus mengarahkan pandangan mereka pada ambang batas 10 persen itu. Tetapi upaya itu tidak diragukan lagi akan diperumit oleh sistem perawatan kesehatan AS yang retak. Di Inggris, yang memiliki satu layanan kesehatan yang dinasionalisasi dan layanan mikrobiologi pendukung, aliran sampel dan data relatif mudah. Di AS, sektor swasta masih mendominasi pasar pengujian. Agar sampel muncul di lab Chiu, katanya, sampel itu harus dikirim dari lab komersial ke lab county dan kemudian ke lab negara sebelum sampai ke dia. Itu bisa memakan waktu berminggu-minggu — bahkan jika itu terjadi sama sekali. Seringkali, pada saat ahli epidemiologi departemen kesehatan masyarakat menemukan kasus yang ingin mereka selidiki dengan genetika, sampel asli telah dibuang. “Langkah pembatasan kecepatan bukanlah pengurutan; itu benar-benar mengambil sampelnya, ”kata Chiu. “Itulah mengapa kami harus memberdayakan laboratorium negara bagian dan kabupaten untuk melakukannya sendiri, sehingga kami dapat mengeluarkan datanya lebih cepat.”

Selama dekade terakhir, laboratorium kesehatan masyarakat telah meningkatkan kapasitas pengurutannya sebagai bagian dari peran mereka dalam melacak wabah penyakit bawaan makanan di seluruh AS. Setiap lab negara bagian, serta beberapa laboratorium regional besar, memiliki teknologi yang tersedia, menurut Wrobleski. Tetapi mereka belum dapat menyebarkannya secara luas selama pandemi karena mereka telah berusaha keras untuk melakukan tes diagnostik dasar dan pelacakan kontak, katanya. Dan sampai beberapa minggu yang lalu, mereka belum diberi perintah untuk melakukan sesuatu yang berbeda.

Tapi itu akhirnya mulai berubah.

Pada pertengahan Desember, CDC merilis $ 15 juta ke laboratorium kesehatan masyarakat di seluruh negeri untuk meningkatkan keluaran sekuensing secara nasional. Itu adalah bagian dari upaya multipel yang sekarang sedang dilakukan di agensi untuk meningkatkan jumlah varian virus corona yang dikarakterisasi dan lokasi pengambilannya. Uang itu akan membantu negara bagian berpartisipasi dalam program Surveilans Strain SARS-CoV-2 khusus, yang dijuluki NS3, yang diluncurkan CDC pada November. Ketika program beroperasi penuh, laboratorium kesehatan masyarakat diharapkan mengirim 10 sampel virus korona yang dipilih secara acak ke laboratorium CDC di Atlanta setiap minggu. Sampel harus mewakili pasien dari berbagai usia, ras, dan kelompok etnis, serta keragaman geografis di setiap negara bagian. Selain mengurutkan mereka, ilmuwan CDC juga akan menggunakan sampel untuk membangun perpustakaan strain terpusat yang dapat mereka celupkan untuk melakukan tes tambahan.

“Pengurutan akan memberi tahu kita banyak hal, tetapi tidak bisa memberi tahu kita semuanya,” kata Gregory Armstrong, yang memimpin Kantor Deteksi Molekuler Lanjutan CDC. Misalnya, salah satu hal yang dikhawatirkan oleh para ahli kesehatan masyarakat adalah seberapa baik orang dengan kekebalan yang diperoleh melalui serangan sebelumnya dengan Covid-19 akan dapat menangkis infeksi dengan jenis baru Inggris ini. Untuk mengujinya, para ilmuwan harus dapat menilai seberapa baik antibodi yang ditemukan dalam darah para penyintas Covid-19 menyerang dan menetralkan virus versi B.1.1.7. Kemungkinan lain yang mengkhawatirkan adalah bahwa vaksin yang telah dikembangkan dan diotorisasi sejauh ini tidak akan efektif melawan strain yang muncul. “Kami perlu memiliki perpustakaan varian untuk mendapatkan jawaban tersebut,” kata Armstrong.

Baca semua liputan virus corona kami di sini.

Program NS3, yang diharapkan Armstrong dapat beroperasi sepenuhnya pada akhir bulan, akan membantu untuk itu. Tetapi AS tidak akan mendapatkan data genetik sebanyak yang dibutuhkan pejabat kesehatan masyarakat untuk melacak perkembangan B.1.1.7 dan strain lain yang muncul, seperti yang mengkhawatirkan yang berasal dari Afrika Selatan, melalui populasi Amerika. Itulah mengapa CDC juga membawa laboratorium pengujian komersial yang besar. Pada bulan Desember, agensi tersebut menandatangani kontrak dengan LabCorp dan Illumina, dan sedang dalam proses menegosiasikan kesepakatan lebih lanjut dengan pihak lain yang memiliki kapasitas untuk memperoleh dan mengurutkan sampel dari seluruh negeri. Selain itu, sejak September, CDC telah memberikan sekitar $ 8 juta kepada pusat pengurutan akademik dan saat ini sedang berupaya menghadirkan situs tambahan secara online. Data dari semua upaya ini terus dianalisis oleh para ilmuwan CDC dan diunggah ke database publik seperti GISAID untuk digunakan peneliti lain.

Diposting oleh : joker123

Releated

2020 Adalah Salah Satu Tahun Terpanas dalam Catatan

2020 Adalah Salah Satu Tahun Terpanas dalam Catatan

[ad_1] Bumi menyala kebakaran tahun lalu (seandainya Anda lupa), dengan kebakaran hutan Pantai Barat yang memecahkan rekor, gelombang panas Siberia, dan badai Atlantik. Sekarang para ilmuwan pemerintah telah menghitung angka di balik kekacauan planet ini. NASA baru saja merilis laporan tahunan tentang suhu tahunan, dan dikatakan bahwa 2020 melampaui atau menyamai 2016 sebagai tahun terpanas […]