Semua Strain Virus Mutant Ini Membutuhkan Nama Kode Baru


Ini bukan Tulio kesalahan de Oliveira bahwa setiap varian virus yang bermutasi yang menyebabkan Covid-19 memiliki lebih dari satu nama, apalagi mereka semua terbaca seperti kata sandi anti-hack. Tetapi de Oliveira mungkin telah mengilhami dorongan internasional baru untuk mengubah sistem itu.

Seorang ahli bioinformatika dan direktur Platform Urutan Riset dan Inovasi KwaZulu-Natal di Universitas KwaZulu-Natal di Afrika Selatan, de Oliveira memimpin tim yang pada bulan Desember mengidentifikasi salah satu varian tersebut — versi SARS-CoV-2 dengan mutasi yang tampaknya membuatnya lebih mudah ditularkan dari orang ke orang. Dalam pandemi, itu buruk.

De Oliveira melakukan apa yang seharusnya Anda lakukan — dia membagikan apa yang dia ketahui tentang susunan genetik dari varian baru ini dengan ribuan ilmuwan di seluruh dunia yang berusaha mengalahkan penyakit tersebut. Salah satu cara terbaik untuk melakukannya adalah dengan memahami bagaimana setiap varian terkait, secara evolusioner dan epidemiologis, dengan yang lain — untuk mencari tahu mengapa beberapa mutasi dapat memberikan kemampuan untuk menyebar lebih cepat dan lebih mudah, mungkin sambil menghindari beberapa formulasi vaksin. Timnya mengurutkan gen varian virus dan mengunggah hasilnya ke database yang disebut GISAID, “Inisiatif Global untuk Berbagi Semua Data Influenza”.

Jika Anda pernah mendengar tentang cabang virus yang ditemukan tim de Oliveira, itu mungkin sebagai “varian yang pertama kali diidentifikasi di Afrika Selatan”. Tapi itu bukan cara para ilmuwan menamai sesuatu. Bagi mereka, itu adalah B.1.351 (dilafalkan “bee dot one dot three five one”).

Di sinilah de Oliveira berkontribusi membuat segalanya lebih rumit. Lihat, para peneliti di Inggris juga telah menemukan varian yang menyebar dengan cepat, yang mereka namakan SARS-CoV-2 VOC 202012/01, cara yang kurang tepat untuk mengatakan bahwa itu adalah “Varian Kepedulian” pertama yang diidentifikasi di Desember 2020. Mutasi kuncinya tampaknya sama dengan varian yang ditemukan de Oliveira, perubahan yang secara teknis disebut “N501Y”. Tetapi salah satu cara untuk mengklasifikasikan varian menurut mutasinya. Jadi semuanya akan membingungkan.

Tapi de Oliveira benar. “Jelas bahwa varian memiliki peran berbeda dalam klasifikasi,” de Oliveira memberi tahu saya. Dia mengusulkan bahwa varian peneliti Inggris akan disebut 501Y.V1 (dan juga B.1.1.7). De Oliveira akan tetap B.1.351, dan juga 501.V2. Anda mungkin juga pernah mendengar varian lain yang disebut 501Y.V3… atau yang disebut P.1… atau yang lain disebut CAL.20C. Mungkin Anda juga mencoba melacak lebih banyak mutasi genetik, seperti E484K (juga dikenal sebagai “Eeek”) atau D614G, “Doug”. Itu adalah nama-nama lucu yang mempercayai beberapa hal buruk dan buruk.

Ilmuwan tidak suka menamai penyakit setelah tempat atau orang (terlalu menstigmatisasi). Mereka lebih menyukai sesuatu yang lebih tepat — dan lebih esoterik. Apa sebutan virus juga, sering kali, fungsinya, atau di mana ia cocok di pohon keluarga. Ilmuwan berdebat tentang nomenklatur, tentang penamaan sesuatu, karena ini adalah proxy untuk memperebutkan tentang hal-hal apa adalah— Secara metodologis, obyektif, dan filosofis. Tapi di tengah pandemi, itu mungkin tidak cukup. “Ini terlalu rumit,” kata Maria Van Kerkhove, kepala unit penyakit baru Organisasi Kesehatan Dunia, dalam sebuah tanya jawab di akhir Januari. “Kami sebenarnya tidak harus menyebutkan setiap varian yang menarik, tetapi kami perlu menyebutkan yang penting, yang berpotensi berdampak pada keparahan, penularan, dan salah satu dari mereka yang berdampak pada terapeutik dan vaksin.” Jadi dengan semua petinggi nomenklatur Covid, WHO telah mulai mencoba mengurai kekacauan penamaan.

Tidak ada epidemi yang pernah membuat begitu banyak orang mengurutkan begitu banyak sampel virus. Pasti ada tumpukan. “Sepertinya itu meledak ke panggung publik. Namun dalam komunitas ilmiah, diskusi ini membahas, ‘Bagaimana kita membicarakannya? Nomenklatur apa yang kami gunakan? ‘ telah berkembang selama beberapa waktu, ”kata Emma Hodcroft, seorang ahli epidemiologi molekuler di Universitas Bern dan rekan pengembang Nextstrain, salah satu upaya utama untuk mengatur urutan genetik virus. “Sebagian besar bergantung pada apa yang Anda lakukan. Apakah Anda melakukan intervensi kesehatan masyarakat atau evolusi skala besar? ”

Diposting oleh : joker123