Strain Coronavirus Baru yang Mengkhawatirkan Muncul. Kenapa sekarang?


“Itu menunjukkan ada keuntungan dari mutasi ini,” kata Stephen Golstein, ahli virologi evolusioner yang mempelajari virus korona di Universitas Utah. “Setiap varian SARS-CoV-2 ‘ingin lebih mudah ditularkan,’ dalam arti tertentu. Jadi fakta bahwa begitu banyak dari mereka yang mendarat di mutasi ini menunjukkan bahwa mungkin ada manfaat nyata untuk melakukannya. Garis keturunan yang berbeda ini pada dasarnya sampai pada solusi yang sama tentang cara berinteraksi secara lebih efisien dengan reseptor manusia, ACE2. ”

Seperti ahli virologi mana pun, Goldstein ragu-ragu untuk membuat antropomorfisme rakyatnya. Virus tidak memiliki mimpi dan keinginan. Mereka adalah mesin mikro cerdas yang diprogram untuk membuat salinan dirinya sendiri sebanyak mungkin. Tapi salah satu cara untuk melakukannya adalah dengan meningkatkan peluang mereka untuk menyerang tuan rumah baru. SARS-CoV-2 melakukannya dengan mengarahkan rangkaian protein lonjakan yang melapisi bagian luarnya menuju protein yang disebut ACE2 yang berada di luar beberapa sel manusia. Lonjakan itu bertatahkan gula yang menyamarkan virus dari sistem kekebalan manusia, kecuali ujung paling ujung, yang dikenal sebagai domain pengikat reseptor, atau disingkat RBD. Bagian yang terbuka ini adalah bagian yang menempel pada ACE2, mengubah bentuk reseptor — seperti kunci yang mengatur ulang gelas di dalam kunci — dan membiarkan virus masuk ke dalam sel dan mulai bereplikasi.

Mutasi yang membuat para ilmuwan begitu khawatir semuanya terjadi dalam sedikit lonjakan yang terekspos itu. Dan sekarang para peneliti berlomba untuk mencari tahu bagaimana masing-masing dari mereka mungkin memberikan beberapa trik baru pada SARS-CoV-2.

Ada N501Y, mutasi yang terjadi pada ketiga varian, yang menggantikan asam amino 501 virus corona, asparagine, dengan tirosin. Studi pada sel dan model hewan menunjukkan bahwa perubahan tersebut memudahkan SARS-CoV-2 untuk meraih ACE2, yang merupakan salah satu hipotesis mengapa varian tersebut, pada titik ini, cukup meyakinkan dikaitkan dengan peningkatan transmisi. Bukti terbaik sejauh ini telah keluar dari Inggris, yang melakukan lebih banyak pengurutan genom daripada negara lain di dunia. Ilmuwan di sana memperkirakan bahwa varian Inggris, atau dikenal sebagai B.1.1.7, antara 30 dan 50 persen lebih menular daripada jenis lain yang beredar.

Di Irlandia, itu menjadi versi virus yang dominan hanya dalam beberapa minggu, dan sejak itu menyebar ke lebih dari 60 negara, termasuk AS. Hingga Selasa, AS telah mendeteksi 293 kasus varian Inggris, menurut data dari Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit AS. Badan tersebut memperkirakan akan menjadi dominan di AS pada Maret.

Varian Brasil, juga disebut P1, dan yang Afrika Selatan, kadang-kadang disebut B.1.351, juga memiliki mutasi kedua dan ketiga yang sama: K417T dan E484K. Saat ini, para ilmuwan tahu lebih banyak tentang yang terakhir. Ini mengubah asam amino yang bermuatan negatif menjadi yang bermuatan positif. Dalam varian tanpa mutasi ini, bagian RBD tersebut berada di seberang bentangan ACE2 yang bermuatan negatif, sehingga mereka saling menjauh. Tapi mutasi E484K membalikkan muatan itu, membuat mereka saling menempel erat.

Pada hari Senin, Minnesota melaporkan kasus pertama varian Brasil di AS, tetapi sejauh ini belum ada kasus varian Afrika Selatan yang dikonfirmasi di AS.

Para ilmuwan di Fred Hutchinson Cancer Research Center menemukan bahwa E484K mungkin merupakan perubahan terpenting dalam hal meningkatkan kemampuan virus untuk menghindari pertahanan kekebalan. Dalam eksperimen laboratorium, mereka mengamati bahwa antibodi dalam darah pasien Covid-19 yang pulih 10 kali lebih efektif dalam menetralkan varian yang memiliki mutasi E484K. Dalam studi terpisah, beberapa rekan De Oliveira menguji darah dari pasien Covid-19 yang jatuh sakit pada gelombang pertama Afrika Selatan, dan mereka menemukan bahwa 90 persen dari mereka mengalami penurunan kekebalan terhadap varian baru yang mengandung E484K. Di hampir setengah dari sampel, varian baru sepenuhnya lolos dari antibodi yang sudah ada sebelumnya. Studi lain oleh kolega Afrika Selatan lainnya, kali ini menggunakan virus hidup, menemukan hasil yang serupa. (Semua dibagikan sebagai pracetak — belum ada yang ditinjau oleh rekan sejawat, seperti yang umum di zaman Covid.)


Diposting oleh : joker123